Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chordc1Q9D1P4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chordc1Q9D1P4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms