Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krcc1Q99JT5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms