Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf9Q8K342 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf9Q8K342 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms