Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4f1Q8CCE9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms