Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1264.5 ms