Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smchd1Q6P5D8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smchd1Q6P5D8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smchd1Q6P5D8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smchd1Q6P5D8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smchd1Q6P5D8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smchd1Q6P5D8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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