Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg9aQ68FE2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg9aQ68FE2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms