Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ctf1Q60753 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms