Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C2cd3Q52KB6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2cd3Q52KB6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms