Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SfswapQ3USH5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SfswapQ3USH5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms