Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rmdn3Q3UJU9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms