Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa11P50709 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa11P50709 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa11P50709 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms