Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms