Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TfamP40630 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TfamP40630 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TfamP40630 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TfamP40630 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TfamP40630 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TfamP40630 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TfamP40630 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TfamP40630 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TfamP40630 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TfamP40630 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TfamP40630 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms