Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rom1P32958 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rom1P32958 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rom1P32958 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rom1P32958 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rom1P32958 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rom1P32958 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rom1P32958 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rom1P32958 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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