Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cnga1P29974 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga1P29974 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms