Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lama1P19137 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lama1P19137 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lama1P19137 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lama1P19137 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms