Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NclP09405 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NclP09405 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NclP09405 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NclP09405 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NclP09405 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NclP09405 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NclP09405 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NclP09405 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NclP09405 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NclP09405 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NclP09405 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NclP09405 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NclP09405 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NclP09405 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NclP09405 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NclP09405 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NclP09405 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NclP09405 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NclP09405 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NclP09405 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NclP09405 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NclP09405 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NclP09405 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NclP09405 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NclP09405 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NclP09405 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NclP09405 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NclP09405 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NclP09405 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NclP09405 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NclP09405 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NclP09405 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NclP09405 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NclP09405 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NclP09405 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NclP09405 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NclP09405 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NclP09405 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NclP09405 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NclP09405 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NclP09405 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms