Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf5O35445 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms