Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad7O35253 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms