Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mfsd4b4J3QNS5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd4b4J3QNS5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms