Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r194J3JS27 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms