Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdh18E9Q9Q6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms