Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep350E9Q309 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep350E9Q309 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
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