Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80eA0A0U1RP99 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ino80eA0A0U1RP99 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms