Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm4Q9QXA5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms