Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Bco1Q9JJS6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bco1Q9JJS6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Bco1Q9JJS6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Bco1Q9JJS6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Bco1Q9JJS6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Bco1Q9JJS6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Bco1Q9JJS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Bco1Q9JJS6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Bco1Q9JJS6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bco1Q9JJS6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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