Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms