Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933402E13RikQ9D4D2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933402E13RikQ9D4D2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933402E13RikQ9D4D2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms