Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D3J9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms