Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl27Q99N92 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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