Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sntg1Q925E1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms