Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk4Q8VEJ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dkk4Q8VEJ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dkk4Q8VEJ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dkk4Q8VEJ3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms