Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Alx1Q8C8B0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alx1Q8C8B0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms