Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ubqln3Q8C5U9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ubqln3Q8C5U9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Ubqln3Q8C5U9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ubqln3Q8C5U9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ubqln3Q8C5U9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ubqln3Q8C5U9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ubqln3Q8C5U9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln3Q8C5U9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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