Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ecm29Q6PDI5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm29Q6PDI5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms