Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NipblQ6KCD5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 312.9 ms