Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf260Q62513 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf260Q62513 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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