Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mre11Q61216 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms