Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pik3c2aQ61194 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pik3c2aQ61194 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pik3c2aQ61194 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms