Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb6Q60692 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms