Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc125Q5U465 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc125Q5U465 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms