Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdc1Q5PSV9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdc1Q5PSV9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms