Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc1Q5NCF2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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