Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam228bQ497Q6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms