Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UST5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UST5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UST5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UST5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UST5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UST5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UST5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UST5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms