Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmod2Q3UHZ5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms