Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms