Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MitfQ08874 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MitfQ08874 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms