Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms